Im seit 2009 bestehenden Schülerlabor der Grünen Schule wird durch den Ansatz des forschend-entdeckenden Lernens ein Beitrag zur BNE geleistet. Ökologisch relevante Themen werden aus verschiedenen Perspektiven heraus beleuchtet, wobei die Schülerinnen und Schüler in den vier Kompetenzbereichen Erkenntnisgewinnung, Fachwissen, Kommunikations- und Bewertungskompetenz geschult werden. Gleichzeitig dient die Grüne Schule der Ausbildung angehender Lehrkräfte. Diese konzipieren und erproben Unterrichtseinheiten zu botanischen und ökologischen Themen, wobei ökonomische und soziale Fragestellungen immer mitgedacht werden. So beispielsweise in einer Unterrichtseinheit zu Südfrüchten, die sich mit der Herkunft der Früchte beschäftigt, die sozialen und ökonomischen Bedingungen der Herstellung thematisiert und die CO2 Bilanz einer solchen Frucht behandelt. Weitere Themen sind beispielsweise Arzneimittel, nachwachsende Rohstoffe oder das Moor. Des Weiteren finden regelmäßig Aktionstage statt, die sich besonders an Kinder und Familien wenden und Themen wie Klimawandel, Energie oder Wasser behandeln. Zudem wurden Fortbildungsprogramme für Eltern entwickelt. Viele Materialien sind publiziert und für andere Projekte verfügbar.