Das Projekt Grüne Uni arbeitet daran, die Universitäten und Fachhochschulen in Berlin zu modernen, nachhaltigen Institutionen zu machen und Studierende sowie Mitarbeiter zu nachhaltigem Handeln zu motivieren. Dazu werden unter anderem Informations- und Bildungsveranstaltungen, Podiumsdiskussionen und Seminare veranstaltet, ein "Umsonstladen" betrieben und die "Woche der Sonne" veranstaltet. In Planung ist ein verpflichtendes Seminar zu Nachhaltigkeitsthemen im Grundstudium für alle Studiengänge an der TU Berlin. Das Projekt sucht die Vernetzung mit Initiativen auch außerhalb der Uni und versucht Einfluss auf politische Entscheidungen zu nehmen. So werden beispielsweise Unterschriftenaktionen organisiert.